【9.2.3】蛋白质三维结构演示-avogadro

一、简介

Avogadro是先进的分子编辑器和可视化工具，专门用于计算化学，分子建模，生物信息学，材料科学及相关领域中的跨平台使用。 它提供了灵活的高质量渲染和强大的插件体系结构。

• 跨平台：适用于Windows，Linux和Mac OS X的分子构建器/编辑器。
• 免费，开源：易于安装，并且所有源代码和文档都可以修改或扩展。
• 国际性：翻译成中文，法文，德文，意大利文，俄文，西班牙文等，还有更多语言可供选择。
• 直观：专为学生和高级研究人员而设计。
• 快速：支持多线程渲染和计算。
• 可扩展：开发人员的插件架构，包括渲染，交互式工具，命令和Python脚本。
• 灵活：功能包括Open Babel导入化学文件，为多个计算化学软件包，晶体学和生物分子生成输入。

http://avogadro.cc/

下载地址：

https://sourceforge.net/projects/avogadro/

二、使用案例

2.1 小分子结构添加H原子

原始结构

“Build"– “Add Hydrogens” ,插入以后